2004年截至2013年底，累计投入了82.7亿元改造农村厕所。

农村改厕的目标是农村卫生厕所普及率2015年达到75，到2020年达到85。 [5] 

2002年，《中共国务院关于进一步加强农村卫生工作的决定》指出，在农村继续以改水改厕为重点，带动环境卫生的整治，以预和减少疾病的发生，促进文明村镇建设。2009年政府又将农村改厕纳入深化医改重大公共卫生服务项目。2010年，启动以农村改厕为重点的城乡环境卫生整洁行动，农村地区卫生厕所普及率快速提升。